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        <dc:description xml:lang="en">&lt;html&gt;&lt;body&gt;&lt;title&gt;AT2G15640.1&lt;/title&gt;(&amp;uarr; Click "Links", if this line appears at the beginning.)&lt;br&gt;&lt;H1&gt;Other supporting information&lt;/H1&gt;&lt;table&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan="2" align="left"&gt;&lt;b&gt;Gene Model&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td NOWRAP width="75"&gt;&lt;/td&gt;&lt;td NOWRAP&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u221564001000i/AT2G15640.1.gene_models.png" width="717"&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=2 align="left"&gt;&lt;b&gt;Correlation Plot&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td NOWRAP colspan="2" align="left"&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u221564001000i/AT2G15640.1.CorrPlot.jpg" width="800"&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;hr&gt;&lt;b&gt;Expression profile (Values are plotted in Log(2) values.)&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u221564001000i/AT2G15640.1.F0.Expression.png"&gt;&lt;br&gt;&lt;hr&gt;&lt;b&gt;Genes with related expresssion profiles.&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;table border=1&gt;&lt;tr&gt;&lt;th colspan=7 align="left"&gt;Positively Correlated Genes&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Gens&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PCC&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene(antisense)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u526515801000i"&gt;AT5G65158.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.785274&lt;/td&gt;&lt;td&gt;FUNCTIONS IN: molecular_function unknown&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u322371501000i"&gt;AT3G23715.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.764678&lt;/td&gt;&lt;td&gt;SCRL13 (SCR-Like 13)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u524144001000i"&gt;AT5G41440.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.744509&lt;/td&gt;&lt;td&gt;zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u323023501000i"&gt;AT3G30235.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.7416&lt;/td&gt;&lt;td&gt;FUNCTIONS IN: molecular_function unknown&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u326093001000i"&gt;AT3G60930.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.738412&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable element gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u325996001000i"&gt;AT3G59960.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.73624&lt;/td&gt;&lt;td&gt;ASHH4 (HISTONE-LYSINE N-METHYLTRANSFERASE ASHH4)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u124314001000i"&gt;AT1G43140.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.733764&lt;/td&gt;&lt;td&gt;ubiquitin protein ligase binding&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u524094001000i"&gt;AT5G40940.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.732769&lt;/td&gt;&lt;td&gt;FLA20 (PUTATIVE FASCICLIN-LIKE ARABINOGALACTAN PROTEIN 20)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u121053001000i"&gt;AT1G10530.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.729331&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u524968002000i"&gt;AT5G49680.2&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.726773&lt;/td&gt;&lt;td&gt;cell expansion protein, putative&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT5P014200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th colspan=7 align="left"&gt;Negatively Correlated Genes&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Gens&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PCC&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene(antisense)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u324586001000i"&gt;AT3G45860.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.737518&lt;/td&gt;&lt;td&gt;receptor-like protein kinase, putative&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT3P110300&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u521876001000i"&gt;AT5G18760.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.721536&lt;/td&gt;&lt;td&gt;zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT5P105500&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u127665001000i"&gt;AT1G76650.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.719489&lt;/td&gt;&lt;td&gt;calcium-binding EF hand family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT1P119930&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT1P022550&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u522521001000i"&gt;AT5G25210.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.697893&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u422799001000i"&gt;AT4G27990.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.696432&lt;/td&gt;&lt;td&gt;YGGT family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT4P107800&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u221512001000i"&gt;AT2G15120.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.677516&lt;/td&gt;&lt;td&gt;pseudogene, disease-resistance family protein / fatty acid elongase-related, similar to fatty acid elongase 1 (FAE1) (Arabidopsis thaliana) GI:881615&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u127713801000i"&gt;AT1G77138.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.675267&lt;/td&gt;&lt;td&gt;other RNA&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u126797001000i"&gt;AT1G67970.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.672959&lt;/td&gt;&lt;td&gt;AT-HSFA8&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT1P116930&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u121874001000i"&gt;AT1G18740.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.670827&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT1P006900&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT1P105990,OMAT1P106000&lt;/td&gt;&lt;td&gt;[OMAT1P105990]-, [OMAT1P106000]-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u320143001000i"&gt;AT3G01430.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.668853&lt;/td&gt;&lt;td&gt;FUNCTIONS IN: molecular_function unknown&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT3P100230&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;br&gt;&lt;a href="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u221564001000i/AT2G15640.1-correlation.txt"&gt;Get whole results&lt;/a&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt; &lt;HR&gt;&lt;b&gt;Over-Representation Analysis Result&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt;&lt;table border="1"&gt;&lt;tr bgcolor=#FF69B4&gt;&lt;td&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 1.00e-06&lt;/td&gt;&lt;td&gt;:20 terms with high significance&lt;/td&gt;&lt;/a&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFACD&gt;&lt;td&gt;1.00e-06 &lt; &lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 8.76e-06&lt;/td&gt;&lt;td&gt;                  :With considering multiple testing correction;&lt;br&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt; &lt;=  1.00e-02 / 1142&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;8.76e-06 &lt; &lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 1.00e-02&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;br&gt;&lt;table border="1"&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Type of term (*1)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Depth of the term in ontology tree&lt;/th&gt;&lt;th&gt;ID/Term&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Description&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Number of genes&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Over-Representative rate (*2)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value (*3)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PosMed &lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value (*4)&lt;br&gt; (Link to PosMed)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Found on gene annotation&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;KW&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0&lt;/td&gt;&lt;td&gt;pollen&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;19/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;2.13&lt;/td&gt;&lt;td&gt;6.70e-04&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;yes&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;KW&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0&lt;/td&gt;&lt;td&gt;stage&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;33/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.70&lt;/td&gt;&lt;td&gt;8.53e-04&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;yes&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;KW&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0&lt;/td&gt;&lt;td&gt;motif&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;11/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;2.26&lt;/td&gt;&lt;td&gt;3.77e-03&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;KW&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0&lt;/td&gt;&lt;td&gt;germinated&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;12/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;2.17&lt;/td&gt;&lt;td&gt;3.96e-03&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;yes&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;KW&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0&lt;/td&gt;&lt;td&gt;conserved&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;22/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.63&lt;/td&gt;&lt;td&gt;9.07e-03&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;table&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*1)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;[KW]:words found in gene description.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*2)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;([# of genes with the term] / [# of sampling (200)]) / ([# of genes with the term among whole genes] / [# of whole genes])          &lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*3)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;P-values were calculated on hypergeometric distribution in which we found &lt;i&gt;n&lt;/i&gt; genes with a annotation term during 200           highly correlated genes, while we had &lt;i&gt;N&lt;/i&gt; genes           with the term in the whole genes.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*4)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="http://omicspace.riken.jp/PosMed-plus/"&gt;PosMed&lt;/a&gt; is a system which serve a p-values showing a relationship           between the gene and the annotation term based on literature information and Gene-Gene interaction suchas co-expression or           protein-protein interactions.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;hr&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s904i"&gt;Top Page&lt;/a&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</dc:description>
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